Research Article

Influence of host cell line and microsporidian species in the in vitro infection efficiency of Encephalitozoon spp.

Influence de la lignée cellulaire hôte et des espèces de microsporidies sur l'efficacité d'infection in vitro d'Encephalitozoon spp.

¹ Université Clermont Auvergne, INSERM UMR 1071, INRAE USC 1382, “Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte” M2iSH, F-63000 Clermont-Ferrand, France
² Université Clermont Auvergne, CNRS, “Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement” LMGE, 1 impasse Amélie Murat - 63170 Aubière, France
³ Unité de Biostatistiques, DRCI, CHU Clermont-Ferrand, 58 rue Montalembert, 63000 Clermont-Ferrand, France
⁴ Université Clermont Auvergne, CHU Clermont-Ferrand, INSERM UMR 1071, INRAE USC 1382, Service de Parasitologie-Mycologie, “Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte” M2iSH, 58 rue Montalembert, 63000 Clermont-Ferrand, France

^* Corresponding author: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Received: 21 January 2026
Accepted: 2 April 2026

Abstract

Microsporidia are obligate intracellular eukaryotes infecting a wide range of hosts and cell types. The development of in vitro culture models is essential for studying host–parasite interactions and the pathogenesis of microsporidian infections. In this study, we compared the infection efficiency of three human pathogenic species of the genus Encephalitozoon (Encephalitozoon intestinalis, E. hellem, and E. cuniculi) across six cell lines: TC7, HT-29, HCT 116, T84, Vero, and MRC-5. Infection rates and the surface area of parasitic foci were determined after labeling microsporidia by fluorescence in situ hybridization (FISH). Both parameters varied significantly according to the cell line and Encephalitozoon species. TC7 cells consistently supported the highest infection rates, whereas HCT 116 cells were the least permissive. The surface areas of foci were primarily species-dependent, with larger foci observed for E. cuniculi and smaller ones for E. intestinalis. In conclusion, these results revealed marked differences in invasive and proliferative dynamics depending on the Encephalitozoon species and cell line and highlight the crucial impact of cell line selection on in vitro experimental outcomes. This work provides a foundation for improving and standardizing experimental models for future experiments on Encephalitozoon spp.

Résumé

Les microsporidies sont des eucaryotes intracellulaires obligatoires qui infectent un large éventail d’hôtes et de types cellulaires. Le développement de modèles de culture in vitro est essentiel pour étudier les interactions hôte-parasite et la pathogenèse des infections microsporidiennes. Dans cette étude, nous avons comparé l’efficacité d’infection de trois espèces pathogènes pour l’Homme du genre Encephalitozoon (Encephalitozoon intestinalis, E. hellem et E. cuniculi) sur les six lignées cellulaires suivantes : TC7, HT-29, HCT 116, T84, Vero et MRC-5. Les taux d’infection et l’aire des foyers parasitaires ont été déterminés après marquage des microsporidies par hybridation in situ en fluorescence (FISH). Les deux paramètres variaient significativement selon la lignée cellulaire et l’espèce d’Encephalitozoon. Les cellules TC7 présentaient systématiquement les taux d’infection les plus élevés, tandis que les cellules HCT 116 étaient les moins permissives. L’aire des foyers était principalement dépendante de l’espèce, avec des foyers généralement plus grands pour E. cuniculi et plus petits pour E. intestinalis. En conclusion, ces résultats révèlent une variabilité considérable des dynamiques invasives et prolifératives selon l’espèce d’Encephalitozoon et la lignée cellulaire, et soulignent l’impact crucial du choix de la lignée cellulaire sur les résultats expérimentaux in vitro. Ce travail fournit une base pour améliorer et standardiser les modèles expérimentaux pour les futures expériences sur Encephalitozoon spp.