Research Article

Genetic diversity of Trichomonads from Milu deer (Elaphurus davidianus) in China

Diversité génétique des Trichomonadida chez le cerf milu (Elaphurus davidianus) en Chine

¹ College of Veterinary Medicine, Anhui Agricultural University, Hefei, Anhui Province, 230036, China
² Beijing Milu Ecological Research Center, Beijing, 100076, China
³ College of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei, Anhui Province, 230036, China
⁴ Biotechnology Center of Anhui Agricultural University, Hefei, Anhui Province, 230036, China

^* Corresponding authors: guoqingyun1987@126.com (Qingyun Guo); congshanyang@sina.cn (Congshan Yang); zhangqingxun1990@126.com (Qingxun Zhang)

Received: 6 September 2024
Accepted: 21 March 2025

Abstract

The Milu deer, or Père David’s deer (Elaphurus davidianus), a rare endemic species in China, represents a case of successful reintroduction of a species previously considered extinct in the wild. Trichomonads, protozoan symbionts capable of infecting vertebrates, are transmitted via the fecal-oral route; they are a subgroup of Parabasalia and include some pathogenic species that pose zoonotic risks. Until now, data on the diversity and prevalence of trichomonads in Chinese Milu deer have not been reported. To better understand the colonization status of trichomonads, fecal samples from 112 Milu deer across five nature reserves in China were collected. The ITS-1/5.8S/ITS-2 sequences were amplified using PCR to investigate the colonization rate of trichomonads and to assess evolutionary relationships and genetic characteristics through phylogenetic analysis. An occurrence of 38.39% was recorded in Milu deer, with sample collection sites (OR = 55.159, 95% CI = 3.166–961.113, p = 0.006), high relative humidity and average annual rainfall (OR = 11.675, 95% CI = 1.747–77.781, p = 0.011) identified as significant risk factors for trichomonads colonization. Undescribed trichomonads from four genera were identified, including Simplicimonas spp., Hypotrichomonas spp., Hexamastix spp., and Tetratrichomonas spp. To our knowledge, this is the first study to report on trichomonads in Milu deer in China. This study aims to enhance understanding of trichomonad colonization and associated risk factors, providing scientific guidance for the ex-situ conservation of Milu deer.

Résumé

Le cerf milu, ou cerf du Père David (Elaphurus davidianus), espèce rare et endémique en Chine, représente un cas de réintroduction réussie d’une espèce auparavant considérée comme éteinte à l’état sauvage. Les Trichomonadida, symbiotes protozoaires capables d’infecter les vertébrés, se transmettent par voie fécale-orale; ils constituent un sous-groupe des Parabasalia et comprennent certaines espèces pathogènes présentant un risque zoonotique. Jusqu’à présent, aucune donnée sur la diversité et la prévalence des Trichomonadida chez le cerf milu n’a été rapportée. Afin de mieux comprendre l’état de colonisation des Trichomonadida, des échantillons fécaux ont été prélevés sur 112 cerfs répartis dans cinq réserves naturelles de Chine. Les séquences ITS-1/5.8S/ITS-2 ont été amplifiées par PCR pour étudier le taux de colonisation des Trichomonadida et évaluer les relations évolutives et les caractéristiques génétiques par analyse phylogénétique. Une occurrence de 38,39 % a été enregistrée chez le cerf milu, les sites de collecte d'échantillons (OR = 55,159, IC à 95 % = 3,166 – 961,113, P = 0,006) et une humidité relative élevée et des précipitations annuelles moyennes élevées (OR = 11,675, IC à 95 % = 1,747 – 77,781, P = 0,011) étant identifiés comme des facteurs de risque significatifs pour la colonisation par les Trichomonadida. Des Trichomonadida non décrits appartenant à quatre genres ont été identifiés, dont Simplicimonas spp., Hypotrichomonas spp., Hexamastix spp. et Tetratrichomonas spp. À notre connaissance, il s’agit de la première étude à signaler la présence de Trichomonadida chez le cerf milu en Chine. Cette étude vise à améliorer la compréhension de la colonisation par les Trichomonadida et des facteurs de risque associés, fournissant ainsi des orientations scientifiques pour la conservation ex situ du cerf milu.