Research Article

First detection and genotyping of Enterocytozoon bieneusi in pet fancy rats (Rattus norvegicus) and guinea pigs (Cavia porcellus) in China

Première détection et génotypage d’Enterocytozoon bieneusi chez des rats (Rattus norvegicus) et des cobayes (Cavia porcellus) de compagnie en Chine

College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang 471003, China

^* Corresponding author: qwf2012@yeah.net

Received: 29 January 2020
Accepted: 21 March 2020

Abstract

Enterocytozoon bieneusi, an obligate intracellular microsporidian parasite, can infect humans and a wide variety of animals worldwide. However, information on the prevalence and molecular characterization of E. bieneusi in pet rats and guinea pigs is lacking. In this study, 325 fecal samples were collected from 152 pet fancy rats and 173 pet guinea pigs purchased from pet shops in Henan and Shandong provinces. The prevalence of E. bieneusi was 11.2% (17/152) in pet fancy rats and 20.2% (35/173) in pet guinea pigs. Genotypes D (n = 12), Peru11 (n = 3), S7 (n = 1) and SCC-2 (n = 1) were identified in pet fancy rats, and genotype S7 (n = 30) and a novel genotype PGP (n = 5) were identified in pet guinea pigs. The ITS sequence and its phylogenetic analysis showed that the novel genotype PGP was distinctly different; it exhibited less than 50% similarity to the reference sequences, and did not cluster with any of the known E. bieneusi genotype groups, forming a unique branch between groups 6 and 7. These data suggest that this is a new E. bieneusi genotype group. This is the first report of E. bieneusi infection in pet fancy rats and pet guinea pigs worldwide. The identification of zoonotic genotypes D, Peru11, and S7 suggests that pet fancy rats and guinea pigs can be potential sources of human microsporidiosis.

Résumé

Enterocytozoon bieneusi, un parasite microsporidien intracellulaire obligatoire, peut infecter les humains et une grande variété d’animaux dans le monde. Cependant, les informations sur la prévalence et la caractérisation moléculaire d’E. bieneusi chez les rats et les cobayes de compagnie manquaient. Dans cette étude, 325 échantillons de matières fécales ont été prélevés de 152 rats et 173 cobayes achetés dans des animaleries dans les provinces du Henan et du Shandong. La prévalence d’E. bieneusi était de 11,2 % (17/152) chez les rats et de 20,2 % (35/173) chez les cobayes. Les génotypes D (n = 12), Peru11 (n = 3), S7 (n = 1) et SCC-2 (n = 1) ont été identifiés chez des rats de compagnie, et le génotype S7 (n = 30) et un nouveau génotype PGP (n = 5) ont été identifiés chez des cobayes de compagnie. La séquence d’ITS et son analyse phylogénétique ont montré que le nouveau génotype PGP était nettement différent ; la séquence présentait moins de 50 % de similitude avec les séquences de référence et ne se regroupait avec aucun des groupes de génotypes connus d’E. bieneusi, formant une branche unique entre les groupes 6 et 7 ; ces données suggèrent qu’il s’agit d’un nouveau groupe de génotype d’E. bieneusi. Ceci est le premier signalement d’infection par E. bieneusi chez des rats et des cobayes de compagnie dans le monde. L’identification des génotypes zoonotiques D, Peru11 et S7 suggère que les rats et les cobayes de compagnie peuvent être des sources potentielles de microsporidiose humaine.