Research Article

First report and multilocus genotyping of Enterocytozoon bieneusi from Tibetan pigs in southwestern China

Premier signalement et génotypage multilocus d’Enterocytozoon bieneusi chez les porcs tibétains du sud-ouest de la Chine

¹ The Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan Province 611130, PR China
² Chengdu Giant Panda Breeding Research Base, Chengdu, Sichuan Province 625001, PR China

^* Corresponding author: pgn.sicau@163.com

Received: 6 November 2018
Accepted: 25 March 2019

Abstract

Enterocytozoon bieneusi is a common intestinal pathogen in a variety of animals. While E. bieneusi genotypes have become better-known, there are few reports on its prevalence in the Tibetan pig. This study investigated the prevalence, genetic diversity, and zoonotic potential of E. bieneusi in the Tibetan pig in southwestern China. Tibetan pig feces (266 samples) were collected from three sites in the southwest of China. Feces were subjected to PCR amplification of the internal transcribed spacer (ITS) region. Enterocytozoon bieneusi was detected in 83 (31.2%) of Tibetan pigs from the three different sites, with 25.4% in Kangding, 56% in Yaan, and 26.7% in Qionglai. Prevalence varies according to age group, from 24.4% (age 0–1 years) to 44.4% (age 1–2 years). Four genotypes of E. bieneusi were identified: two known genotypes EbpC (n = 58), Henan-IV (n = 24) and two novel genotypes, SCT01 and SCT02 (one of each). We compare our results with a compilation of published results on the host range and geographical distribution of E. bieneusi genotypes in China. Phylogenetic analysis showed these four genotypes clustered to group 1 with zoonotic potential. Multilocus sequence typing (MLST) analysis of three microsatellites (MS1, MS3, MS7) and one minisatellite (MS4) was successful in 47, 48, 23 and 47 positive specimens and identified 10, 10, 5 and 5 genotypes at four loci, respectively. This study indicates the potential danger of E. bieneusi to Tibetan pigs in southwestern China, and offers basic advice for preventing and controlling infections.

Résumé

Enterocytozoon bieneusi est un agent pathogène intestinal commun chez de nombreux animaux. Bien que les génotypes d’E. bieneusi soient mieux connus, il existe peu de rapports sur sa prévalence chez le porc tibétain. Cette étude a examiné la prévalence, la diversité génétique et le potentiel zoonotique d’E. bieneusi chez le porc tibétain du sud-ouest de la Chine. Des matières fécales de porcs tibétains (266 échantillons) ont été collectées sur trois sites dans le sud-ouest de la Chine. Les matières fécales ont été soumises à une amplification PCR de la région de l’espaceur interne transcrit (ITS). Enterocytozoon bieneusi a été détecté chez 83 (31,2 %) des porcs tibétains des trois sites différents, dont 25,4 % à Kangding, 56 % à Yaan et 26,7 % à Qionglai. La prévalence varie selon le groupe d’âge, de 24,4 % (0 à 1 an) à 44,4 % (1 à 2 ans). Quatre génotypes d’E. bieneusi ont été identifiés : deux génotypes connus, EbpC (n = 58), Henan-IV (n = 24) et deux nouveaux génotypes, SCT01 et SCT02 (un cas de chaque). Nous comparons nos résultats avec une compilation des résultats publiés sur les hôtes et la répartition géographique des génotypes d’E. bieneusi en Chine. L’analyse phylogénétique a montré que ces quatre génotypes étaient regroupés dans le groupe 1, avec potentiel zoonotique. L’analyse par typage de séquence multilocus (MLST) de trois microsatellites (MS1, MS3, MS7) et d’un minisatellite (MS4) a été réussie chez 47, 48, 23 et 47 spécimens positifs et a identifié 10, 10, 5 et 5 génotypes à quatre loci, respectivement. Cette étude indique le danger potentiel d’E. bieneusi pour les porcs tibétains du sud-ouest de la Chine et propose des conseils de base pour la prévention et le contrôle des infections.