Research Article

A fast and reliable molecular method to detect Anisakidae in zooplanktonic Euphausiacea

Une méthode moléculaire rapide et fiable pour la détection des Anisakidae chez les Euphausiacea zooplanctoniques

¹ ANSES, Laboratory for Food Safety, F-62200 Boulogne-sur-Mer, France
² Univ. Lille, CNRS, Université Littoral Côte d’Opale, IRD, UMR 8187 LOG- Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences, F-59000 Lille, France
³ IFREMER, Channel and North Sea Fisheries Research Unit, 150 Quai Gambetta, BP 699, F-62200 Boulogne-sur-Mer, France

^* Corresponding author: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Received: 6 February 2026
Accepted: 22 June 2026

Abstract

Anisakidae is a family of marine nematodes, largely monitored in fish and cephalopods due to their zoonotic risk for human consumers. However, there is a need to further study the ecology of this family to better predict infection dynamics, particularly as global change affects marine ecosystem functioning generally, and specifically Anisakidae behaviour and infection levels, in line with the principles of the One Health approach. However, in-depth studies are hampered by technical difficulties in collecting data on members of the cycle that are not consumed by humans, namely zooplankton. This results in a glaring imbalance in terms of available data between fish and cephalopods on the one hand, and zooplankton on the other. Development of robust, rapid, and efficient methods for the detection of Anisakidae in zooplankton is therefore needed. Euphausiacea is considered to be the major zooplanktonic group hosting Anisakidae larvae. We therefore calibrated a PCR technique followed by Sanger sequencing to determine the presence of Anisakidae larvae in zooplanktonic Euphausiacea from the North Sea. This calibration was based in particular on the creation of artificially infested zooplanktonic samples, on which several molecular methods have been tested. When calibrated, we then applied this method to a small set of zooplanktonic samples and performed a preliminary parasitological survey. Prevalence values were higher (2.5% to 4.5%) than those reported in the literature, either due to the increased sensitivity of the molecular method and/or to changes in ecosystem functioning. This method has clear potential to push forward an integrated understanding of Anisakidae infection in zooplankton.

Résumé

Les Anisakidae constituent une famille de nématodes marins, largement surveillés chez les poissons et les céphalopodes en raison du risque zoonotique qu’ils représentent pour l’homme. Néanmoins, une meilleure compréhension de l’écologie de cette famille est nécessaire pour une prédiction plus précise de la dynamique des infections, notamment face aux changements globaux qui affectent le fonctionnement des écosystèmes marins en général, et plus particulièrement le comportement et les niveaux d’infection par les Anisakidae, conformément aux objectifs de l’approche « Une seule santé ». Cependant, cette démarche est freinée par la difficulté technique de collecter des données sur les membres du cycle non consommés par l’homme, à savoir le zooplancton. Il en résulte un déséquilibre important dans les données disponibles entre les poissons et les céphalopodes d’une part, et le zooplancton d’autre part. Le développement de méthodes robustes, rapides et efficaces pour la détection des Anisakidae dans le zooplancton est donc indispensable. Les Euphausiacea sont considérés comme le principal groupe zooplanctonique hébergeant les larves d’Anisakidae. Nous avons ainsi calibré une méthode de PCR suivie d'un séquençage Sanger pour déterminer la présence de larves d'Anisakidae chez les euphausiacés zooplanctoniques de la mer du Nord. Cette calibration s'est notamment appuyée sur la création d'échantillons zooplanctoniques infestés artificiellement, sur lesquels plusieurs méthodes moléculaires ont été testées. Une fois calibrée, nous avons appliqué cette méthode à un petit ensemble d'échantillons zooplanctoniques et réalisé une étude parasitologique préliminaire. Les valeurs de prévalence étaient plus élevées (2,5 % à 4,5 %) que celles rapportées dans la littérature, probablement en raison de la sensibilité accrue de la méthode moléculaire et/ou de modifications du fonctionnement de l'écosystème. Cette méthode présente un potentiel certain pour faire progresser la compréhension intégrée de l'infestation par les Anisakidae chez le zooplancton.