Research Article

Culturable bacteria and fungi in Ixodes, Dermacentor, Amblyomma and Ornithodoros ticks

Bactéries et champignons cultivables chez les tiques Ixodes, Dermacentor, Amblyomma et Ornithodoros

¹ MIVEGEC (Maladies Infectieuses et Vecteurs : Ecologie, Génétique, Evolution et Contrôle), University of Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut pour la Recherche et le Développement (IRD), 34394 Montpellier, France
² ASTRE, CIRAD, INRAE, University of Montpellier, 34398 Montpellier, France

^* Corresponding author: olivier.duron@ird.fr; olivier.duron@cnrs.fr

Received: 10 December 2024
Accepted: 12 March 2025

Abstract

Ticks are ectoparasites harboring complex microbial communities, typically dominated by nutritional symbionts that produce B vitamins and sometimes including pathogens affecting human and animal health. However, ticks also host a variety of commensal microbes whose diversity remains poorly documented. In this study, we isolated and identified culturable bacteria and fungi associated with various tick species from the genera Ixodes, Dermacentor, Amblyomma, and Ornithodoros, collected from their natural habitats or hosts in France and French Guiana. A total of 111 bacterial and 27 fungal isolates were obtained which were then identified using both molecular and morphological approaches. Substantial fungal diversity was observed in a few ticks, whereas culturable bacteria displayed a broader distribution and diversity across tick species. Interestingly, the diversity of culturable bacteria and fungi revealed a microbiome structure that reflected the ecological niches of the tick host, indicating habitat-specific microbial associations and a potential ecological role in tick biology. The isolation of common gut bacteria of other arthropods, as well as the isolation of a viable entomopathogenic fungus, underscores the potential influence of these microbes on tick biology.

Résumé

Les tiques sont des ectoparasites abritant des communautés microbiennes complexes, généralement dominées par des symbiotes nutritionnels qui produisent des vitamines B et parfois incluant des pathogènes affectant la santé humaine et animale. Cependant, les tiques hébergent également une variété de microbes commensaux dont la diversité reste mal documentée. Dans cette étude, nous avons isolé et identifié des bactéries et champignons cultivables associés à diverses espèces de tiques des genres Ixodes, Dermacentor, Amblyomma et Ornithodoros, collectées dans leurs habitats naturels ou hôtes en France et en Guyane française. Au total, 111 isolats bactériens et 27 isolats fongiques ont été obtenus, qui ont ensuite été identifiés à l’aide d’approches moléculaires et morphologiques. Une diversité fongique substantielle a été observée chez quelques tiques, tandis que les bactéries cultivables présentaient une distribution et une diversité plus larges parmi les espèces de tiques. Il est intéressant de noter que la diversité des bactéries et des champignons cultivables a révélé une structure du microbiome qui reflétait les niches écologiques de l’hôte tique, indiquant des associations microbiennes spécifiques à l’habitat et un rôle écologique potentiel dans la biologie des tiques. L’isolement de bactéries intestinales communes d’autres arthropodes, ainsi que l’isolement d’un champignon entomopathogène viable, soulignent l’influence potentielle de ces microbes sur la biologie des tiques.