Research Article

Cryptosporidium spp. prevalence in the general population in Guinea: first large-scale screening study

Prévalence de Cryptosporidium spp. dans la population générale en Guinée : première étude de dépistage à grande échelle

¹ CNRS, Inserm, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019-UMR 9017-CIIL-Centre d’Infection et d’Immunité de Lille, Université de Lille, 59000 Lille, France
² Unité d’Appui à la Gestion et la Coordination des Programmes, Ministère de la Santé et de l’Hygiène Publique, Conakry BP 585, Guinea
³ Hôpital National Ignace Deen CHU de Conakry, Laboratoire de Parasitologie, Conakry BP 1263, Guinea
⁴ Centre de Santé Anastasis, Conakry BP 1032, Guinea
⁵ Délégation à la Recherche Clinique et à l’Innovation, Groupement des Hôpitaux de l’Institut Catholique de Lille, Lille Catholic University, 59000 Lille, France

^* Corresponding author: gabriela.certad@pasteur-lille.fr

Received: 9 August 2024
Accepted: 24 October 2024

Abstract

Cryptosporidium is a leading cause of diarrheal mortality in children in Africa and Asia. Despite the public health significance of this parasite, its molecular epidemiology and circulation in Guinea remain poorly understood. Therefore, this study aimed to determine the prevalence and genotype distribution of Cryptosporidium in the Guinean general population. To achieve this, fecal samples were collected from 834 individuals, both with and without digestive disorders, at two hospitals in Conakry. The presence of the parasite in the stool samples was detected using nested PCR targeting the SSU rDNA gene, followed by sequencing of the PCR products for genotyping of the isolates. The PCR-based prevalence was 0.12% for the whole cohort, and 0.2% among adults. The low frequency of Cryptosporidium observed in the current study is thus consistent with the prevalence of this parasite already reported in certain other African countries. The species identified in the positive samples was Cryptosporidium hominis. This study is the first to report the prevalence of Cryptosporidium in the general population of Guinea. Given the potential of this parasite to cause life-threatening diarrhea, further studies are needed to clarify the epidemiology of Cryptosporidium in this country.

Résumé

Cryptosporidium est une cause majeure de mortalité diarrhéique chez les enfants en Afrique et en Asie. Malgré l’importance de ce parasite en matière de santé publique, son épidémiologie moléculaire et sa circulation en Guinée restent mal comprises. Par conséquent, cette étude visait à déterminer la prévalence et la distribution génotypique de Cryptosporidium dans la population générale guinéenne. Pour y parvenir, des échantillons fécaux ont été collectés auprès de 834 individus, avec et sans troubles digestifs, dans deux hôpitaux de Conakry. La présence du parasite dans les échantillons de selles a été détectée à l’aide d’une PCR imbriquée ciblant le gène SSU ADNr, suivie d’un séquençage des produits de PCR pour le génotypage des isolats. La prévalence basée sur la PCR était de 0,12 % pour l’ensemble de la cohorte et de 0,2% chez les adultes. La faible fréquence de Cryptosporidium observée dans la présente étude est donc cohérente avec la prévalence de ce parasite déjà rapportée dans certains autres pays africains. L’espèce identifiée dans les échantillons positifs était Cryptosporidium hominis. Cette étude est la première à rapporter la prévalence de Cryptosporidium dans la population générale de Guinée. Étant donné le potentiel de ce parasite à provoquer une diarrhée potentiellement mortelle, d’autres études sont nécessaires pour clarifier l’épidémiologie de Cryptosporidium dans ce pays.