Research Article

First detection of Eimeria species in Myanmar domestic goats with both microscopic and molecular methods

Première détection d’espèces d’Eimeria chez les chèvres domestiques du Myanmar à l’aide de méthodes microscopiques et moléculaires

¹ Department of Pharmacology and Parasitology, University of Veterinary Science, Yezin, 15013 Nay Pyi Taw, Myanmar
² Department of International Relations and Information Technology, University of Veterinary Science, Yezin, 15013 Nay Pyi Taw, Myanmar
³ Laboratory of Parasitology, Faculty of Veterinary Medicine, Hokkaido University, 060-0818 Sapporo, Japan

^* Corresponding author: bestshadow@gmail.com; sawvet@uvsyezin.edu.mm

Received: 11 November 2019
Accepted: 8 May 2020

Abstract

Coccidiosis is of great economic importance in many farm animals. This study involved analysis of 280 faecal samples collected from 12 traditional goat farms from Nay Pyi Taw area, Myanmar. Faecal samples were examined by the flotation method and concentrated oocysts were identified on the basis of morphological characters. Of 280 faecal samples examined, 168 (60.0%) were positive for Eimeria oocysts. Three different Eimeria species were identified and their positive detection rates in the herd were: E. arloingi (25.4%), followed by E. hirci (20.7%) and E. christenseni (13.9%). Identifications were confirmed by 18S rDNA and COI sequences. 18S rDNA sequences showed 100% homology with, respectively, E. christenseni reported from Australia, E. arloingi reported from Australia and Iran, and E. hirci from Australia. COI sequences of E. christenseni, E. hirci, and E. arloingi, respectively, exhibited 98.9%, 98.4%, and 98.5% similarities with those reported from Australia. This is the first report of Eimeria infection in Myanmar goats.

Résumé

La coccidiose est d’une grande importance économique pour de nombreux animaux d’élevage. L’étude a impliqué l’analyse de 280 échantillons de matières fécales prélevés dans 12 fermes caprines traditionnelles de la région de Nay Pyi Taw, Myanmar. Les échantillons fécaux ont été examinés par la méthode de flottation et des oocystes concentrés ont été identifiés sur la base de caractères morphologiques. Sur 280 échantillons fécaux examinés, 168 (60,0 %) étaient positifs pour les oocystes d’Eimeria. Trois espèces différentes d’Eimeria ont été identifiées et leurs taux de détection positifs dans le troupeau étaient: E. arloingi (25,4 %), suivi par E. hirci (20,7 %) et E. christenseni (13,9 %). Les identifications ont été confirmées par les séquences d’ADNr 18S et de COI. Les séquences d’ADNr 18S ont montré une homologie de 100 % avec, respectivement, E. christenseni d’Australie, E. arloingi d’Australie et d’Iran et E. hirci d’Australie. Les séquences de COI d’E. christenseni, E. hirci et E. arloingi présentaient des similitudes de 98,9 %, 98,4 % et 98,5 %, respectivement, avec celles rapportées d’Australie. Il s’agit du premier signalement d’infection à Eimeria chez des chèvres du Myanmar.