Short Note

Molecular detection of Enterocytozoon bieneusi in alpacas (Vicugna pacos) in Xinjiang, China

Détection moléculaire d’Enterocytozoon bieneusi chez les alpagas (Vicugna pacos) du Xinjiang, en Chine

¹ College of Animal Science, Tarim University, Alar, Xinjiang 843300, PR China
² Experimental and Research Center, Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, Henan 450046, PR China
³ Department of Pathogenic Biology, Hainan Medical University, Haikou, Hainan 571100, PR China

^* Corresponding author: qimengdz@163.com

Received: 17 March 2019
Accepted: 9 May 2019

Abstract

Enterocytozoon bieneusi, an obligate intracellular pathogen, can infect a wide variety of hosts. This study aimed to determine the prevalence and molecular characteristics of E. bieneusi in alpacas (Vicugna pacos) in China. A total of 185 alpaca fecal samples were collected from five herds in Tacheng, Wensu, Hejing, Qinghe, and Nilka counties in Xinjiang Uygur Autonomous Region. Enterocytozoon bieneusi was detected by nested PCR of the internal transcribed spacer (ITS) region. Twenty-eight fecal samples (15.1%, 28/185) were positive for E. bieneusi, with the highest prevalence in alpacas from Qinghe (42.9%, 15/35). Four E. bieneusi genotypes were identified, which included two known (P and ALP3) and two novel (ALP7 and ALP8) genotypes. Genotype ALP3 was the dominant genotype (57.1%, 16/28), followed by genotypes P (32.1%, 9/28), ALP7 (7.1%, 2/28), and ALP8 (2.6%, 1/28). Phylogenetic analysis revealed that three genotypes (P, ALP7, and ALP3) clustered into group 1, whereas genotype ALP8 clustered into group 8. This is the first report of E. bieneusi infection and genetic diversity in alpacas from Xinjiang, China.

Résumé

Enterocytozoon bieneusi, un agent pathogène intracellulaire obligatoire, peut infecter une grande variété d’hôtes. Cette étude visait à déterminer la prévalence et les caractéristiques moléculaires d’E. bieneusi chez les alpagas (Vicugna pacos) en Chine. Au total, 185 échantillons de selles d’alpagas ont été prélevés dans cinq troupeaux des comtés de Tacheng, Wensu, Hejing, Qinghe et Nilka, dans la région autonome ouïgoure du Xinjiang. Enterocytozoon bieneusi a été détecté par PCR nichée de la région de l’espaceur interne transcrit (ITS). Vingt-huit échantillons de selles (15,1 %, 28/185) étaient positifs pour E. bieneusi, la prévalence étant la plus élevée chez les alpagas de Qinghe (42,9 %, 15/35). Quatre génotypes d’E. bieneusi ont été identifiés, dont deux génotypes connus (P et ALP3) et deux nouveaux (ALP7 et ALP8). Le génotype ALP3 était le génotype dominant (57,1 %, 16/28), suivi des génotypes P (32,1 %, 9/28), ALP7 (7,1 %, 2/28) et ALP8 (2,6 %, 1/28). Une analyse phylogénétique a révélé que 3 génotypes (P, ALP7 et ALP3) appartenaient au groupe 1, tandis que le génotype ALP8 appartenait au groupe 8. Il s’agit du premier rapport sur l’infection à E. bieneusi et sa diversité génétique chez les alpagas du Xinjiang en Chine.