Research Article

Prevalence and genotype identification of Toxoplasma gondii in suburban rodents collected at waste disposal sites

Prévalence et identification du génotype de Toxoplasma gondii chez des rongeurs suburbains collectés dans des décharges

Department for Biodiversity, Faculty of Mathematics, Natural Sciences and Information Technologies, University of Primorska, 6000 Koper, Slovenia

^* Corresponding author: ivovic.v@gmail.com

Received: 4 March 2019
Accepted: 16 April 2019

Abstract

To assess the prevalence of Toxoplasma gondii infection in native and commensal rodents as indicators of environmental pollution, we analyzed brain tissue from small mammals collected on legal and illegal waste sites in the Slovenian and Croatian parts of Istria. A total of 136 animals and five species of the family Muridae were analyzed: black rat (Rattus rattus), domestic mouse (Mus musculus), wood mouse (Apodemus sylvaticus), striped field mouse (Apodemus agrarius), and yellow-necked mouse (Apodemus flavicollis). Using quantitative Polymerase Chain Reaction (qPCR), T. gondii DNA was detected in four homogenized brain tissue samples (2.94%), from all of the analyzed species, except black rat. Out of these, two samples, domestic mouse (Mus musculus) and wood mouse (Apodemus sylvaticus) had sufficient DNA for genotyping of T. gondii isolates in which we demonstrated the presence of clonal type II using RFLP PCR with four markers (SAG1, SAG2, GRA6 and GRA7). Three of four infected animals (75%) were collected on dumpsites.

Résumé

Pour évaluer la prévalence de l’infection à Toxoplasma gondii chez les rongeurs indigènes et commensaux en tant qu’indicateurs de pollution environnementale, nous avons analysé le tissu cérébral de petits mammifères collectés sur des décharges légales et illégales des parties slovène et croate de l’Istrie. Au total, 136 animaux et cinq espèces de la famille des muridés ont été analysés : rat noir (Rattus rattus), souris domestique (Mus musculus), mulot sylvestre (Apodemus sylvaticus), souris des champs à rayures (Apodemus agrarius) et souris à collier (Apodemus flavicollis). À l’aide de la PCR quantitative, l’ADN de T. gondii a été détecté dans 4 échantillons de tissu cérébral homogénéisés (2,94 %) appartenant à toutes les espèces analysées, à l’exception du rat noir. Deux de ces échantillons, de souris grise (Mus musculus) et mulot sylvestre (Apodemus sylvaticus), contenaient suffisamment d’ADN pour le génotypage des isolats de T. gondii, dans lesquels nous avons démontré la présence de clones de type II en utilisant la PCR RFLP avec quatre marqueurs (SAG1, SAG2, GRA6 et GRA7). Trois des 4 animaux infectés (75 %) ont été collectés sur des décharges.