Research Article

A new data management system for the French National Registry of human alveolar echinococcosis cases

Un nouveau système de base de données pour le registre national français des cas humains d’échinococcose alvéolaire

¹ Laboratoire Chrono-Environnement, UMR/CNRS 6249 University of Franche-Comté, 25000 Besançon, France
² OSU THETA Franche-Comté Bourgogne, 25000 Besançon, France
³ National Reference Centre of Alveolar Echinococcosis – FrancEchino Network – WHO Collaborating Centre for Prevention and Treatment of Human Alveolar Echinococcosis, University Hospital Centre of Besançon, 25000 Besançon, France

^* Corresponding author: jenny.knapp@univ-fcomte.fr

Received: 29 October 2014
Accepted: 12 December 2014

Abstract

Alveolar echinococcosis (AE) is an endemic zoonosis in France due to the cestode Echinococcus multilocularis. The French National Reference Centre for Alveolar Echinococcosis (CNR-EA), connected to the FrancEchino network, is responsible for recording all AE cases diagnosed in France. Administrative, epidemiological and medical information on the French AE cases may currently be considered exhaustive only on the diagnosis time. To constitute a reference data set, an information system (IS) was developed thanks to a relational database management system (MySQL language). The current data set will evolve towards a dynamic surveillance system, including follow-up data (e.g. imaging, serology) and will be connected to environmental and parasitological data relative to E. multilocularis to better understand the pathogen transmission pathway. A particularly important goal is the possible interoperability of the IS with similar European and other databases abroad; this new IS could play a supporting role in the creation of new AE registries.

Résumé

L’échinococcose alvéolaire (EA) est une zoonose endémique en France, due au cestode Echinococcus multilocularis. Le Centre National de Référence français de l’échinococcose alvéolaire (CNR-EA), lié au réseau FrancEchino est en charge de l’enregistrement de tous les cas d’EA diagnostiqués en France. Les informations administratives, épidémiologiques et médicales sur les cas d’EA français ne sont actuellement exhaustives que pour la période du diagnostic. Dans le but de constituer un jeu de données de référence, un système d’information (SI) a été développé grâce à un système de gestion de base de données relationnelle (langage MySQL). L’actuel jeu de données évoluera vers un système de surveillance dynamique, prenant en compte les données de suivi (par exemple, données d’imagerie, sérologie) et sera connecté à des données environnementales et parasitologiques, relatives à E. multilocularis, pour mieux comprendre les voies de transmission du pathogène. Un point particulièrement important ici est la possibilité du SI d’être interopérable avec d’autres bases de données similaires, en Europe et ailleurs ; ce nouveau SI pourrait donc servir de support à la création de nouveaux registres de l’EA.