Research Article

Echinococcus granulosus genomics: a new dawn for improved diagnosis, treatment, and control of echinococcosis

Le séquençage total d’Echinococcus granulosus : début d’une nouvelle ère pour l’amélioration du diagnostic, du traitement et du contrôle de l’échinococcose.

¹ State Key Laboratory Incubation Base of Xinjiang Major Diseases Research, Clinical Medical Research Institute, The First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University, Urumqi, PR China
² Shanghai–Ministry of Science and Technology Key Laboratory of Health and Disease Genomics, Chinese National Human Genome Center at Shanghai, Shanghai, PR China
³ Molecular Parasitology Laboratory, QIMR Berghofer Medical Research Institute, Brisbane, Queensland, Australia

^* Corresponding author: wenbaozhang2013@163.com

Received: 12 August 2014
Accepted: 2 December 2014

Abstract

Cystic echinococcosis (CE) is a cosmopolitan disease caused by the dog tapeworm Echinococcus granulosus. The disease is difficult to diagnose, treat, and control and is responsible for considerable human morbidity and mortality globally. There is an urgent need for new diagnostic tests and new drugs for treatment of CE and the development of a vaccine against adult worms of E. granulosus in dogs. We recently presented a draft genomic sequence for the worm comprising 151.6 Mb encoding 11,325 proteins. We undertook an extensive comparative analysis of the E. granulosus transcriptome using representative life stages (protoscoleces, cyst germinal cells and membranes, adult worms, and oncospheres) to explore different aspects of tapeworm biology and parasitism. The genome and transcriptome of E. granulosus provide a unique platform for post-genomic research and to facilitate the development of new, effective treatments and interventions for echinococcosis control.

Résumé

L’échinococcose kystique (EK) est une maladie cosmopolite due à l’infection par le ténia du chien Echinococcus granulosus. La maladie est difficile à diagnostiquer, à traiter et à contrôler; elle est responsable au plan mondial d’une considérable morbidité et mortalité. Il est urgent de découvrir de nouveaux tests diagnostiques et de nouveaux médicaments pour traiter l’EK, ainsi qu’un vaccin contre le développement des vers adultes d’E. granulosus chez le chien. Nous avons récemment publié la séquence génomique de ce parasite, qui comprend 151.6 Mb codant 11,325 protéines. Nous avons aussi analysé le transcriptome et comparé l’expression génique dans les principaux stades parasitaires (protoscolex, cellules germinatives et membranes du kyste, vers adultes et oncosphères) pour explorer différents aspects de la biologie et du parasitisme de ce cestode. La connaissance du génome et du transcriptome d’E. granulosus représente une base sans précédent pour le développement de recherches post-génomiques et leur application à la découverte de traitements novateurs et d’outils de prévention.