Original contribution

Genotype identification of Enterocytozoon bieneusi isolates from stool samples of HIV-infected Tunisian patients

Identification de génotypes d’Enterocytozoon bieneusi isolés d’échantillons de selles de patients Tunisiens infectés par le VIH

¹ Laboratoire de recherche “Parasitoses médicales, biotechnologie et bio-molécules” LR 11-IPT-06 & Laboratoire de parasitologie, Institut Pasteur de Tunis, Tunisie
² Service des maladies infectieuses, Hôpital de la Rabta, Tunis, Tunisie
³ Hôpital de la Pitié-Salpétrière, Unité INSERM 511, Université Paris VI Pierre et Marie Curie, Paris, France

^* Correspondence: Karim Aoun, Laboratoire de parasitologie, Institut Pasteur de Tunis, 13, place Pasteur, BP 74, 1002 Tunis Belvédère, Tunisie. Tel.: 216 98 699 512. E-mail: karim.aoun@pasteur.rns.tn

Received: 4 August 2011
Accepted: 4 December 2011

Abstract

The microsporidian species Enterocytozoon bieneusi is a major cause of chronic diarrhea and malabsorption in patients with AIDS. Genotyping was performed on seven E. bieneusi strains for the first time in Tunisia. All the strains were isolated from stool samples of humans with immunodeficiency virus (HIV) infection. Analysis of the ribosomal RNA gene internal transcribed spacer (rDNA ITS) allowed the identification of three distinct genotypes previously described in other studies. Genotypes D and B were characterized in four and two respectively. The Peruvian genotype (Peru 8) was detected in the last isolate. These results indicate a genetic diversity in E. bieneusi strains from HIV Tunisian patients and suggest the coexistence of both zoonotic and anthroponotic route of transmission.

Résumé

Enterocytozoon bieneusi est l’espèce de microsporidies la plus fréquente chez l’homme. C’est l’une des causes majeures de diarrhées chroniques et de malabsorption chez les patients atteints de SIDA. Le génotypage de souches d’E. bieneusi a été effectué pour la première fois en Tunisie. Il a concerné, par l’analyse de la séquence ITS du gène codant l’ARN ribosomique (rDNA ITS), sept isolats obtenus de selles de sujets infectés par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH). Trois génotypes différents ont été identifiés. Le génotype D et le génotype B ont été détectés respectivement dans quatre et deux isolats. Le génotype Peru 8, antérieurement décrit uniquement au Pérou, a été détecté dans le dernier isolat. Ces résultats témoignent de la diversité génétique des souches d’E. bieneusi en Tunisie et suggèrent la coexistence de modes de transmission aussi bien zoonotiques qu’anthroponotiques.