Note de recherche

A synthetic oligonucleotide probe that discriminates between the subgenera Schizotrypanum and Megatrypanum

Une sonde oligonucléotidique synthétique capable de faire la discrimination entre les sous-genres Schizotrypanum et Megatrypanum

¹ Dept. Biochemistry & Molecular Biology.
² Dept. Protozoology, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ. Av. Brasil 4365, Manguinhos 21045-900. Rio de Janeiro RJ, Brazil.

^* Corresponding author: R.S. Pacheco. Tel: 005521 2907549 - Fax : 005521 5903495.

Received: 23 February 1996
Accepted: 6 May 1996

Abstract

The article reports the use of synthetic oligonucleotides as an additional tool for discriminating between the subgenera Schizotrypanum and Megatrypanum of the genus Trypanosoma. Three oligonucleotides were synthezised based on conserved sequence blocks in the minirepeat of the kinetoplast DNA minicircles (kDNA| from T. cruzi and used as probes in dot-blot hybridization experiments against kDNA from trypanosomatids belonging to different genera. Under specific hybridization and washing conditions the oligoprobes were found to hybridize distinctly with protozoa from the subgenera Schizotrypanum and Megatrypanum and with two monogenetic insect trypanosomatids. One of the oligonucleotides showed to be specific for the subgenus Schizotrypanum. No cross-hybridization was detected with T. rangeli, which, in fact, belongs to another subgenus (Tejeraia, Añez, 1982), confirming the specificity of the probe. This promissing result reinforces the use of oligoprobes for typing of trypanosomes.

Résumé

L'article montre l'utilisation d'oligonucléotides synthétiques comme un outil additionnel capable de discriminer entre les sous-genres Schizotrypanum et Megatrypanum du genre Trypanosoma. Trois oligonucléotides ont été synthétisés selon les séquences conservées des régions des minicercles du DNA du kinétoplaste (kDNA) de T, cruzi. Ces oligonucléotides ont été utilisés comme sondes sur des hybridations en dot-blot contre des trypanosomatides appartenant à différents genres. Sous des conditions d'hybridation et lavage particulières les oligosondes ont hybridé spécifiquement avec des protozoaires des sous-genres Schizotrypanum et Megatrypanum et avec deux trypanosomatides monogénétiques d'insecte. Pourtant, un des oligonucléotides a révélé être spécifique pour le genre Schizotrypanum. Il n'y a pas eu d'hybridation croisée avec T. rangeli, qui appartient à un autre sous-genre (Tejeraia, Añez, 1982), ce qui a confirmé la spécificité de la sonde. Ce résultat encourageant suggère l'utilisation des oligosondes pour le typage des trypanosomes.